山东大学控制科学与工程学院建有“控制理论与控制工程”国家(国防)重点学科,拥有“控制科学与工程”“生物医学工程”一级学科博士学位授予权和博士后流动站,拥有“控制理论与控制工程”“电力电子与电力传动”“检测技术与自动化装置”“模式识别与智能系统”“系统工程”、“导航制导与控制”“物流工程”二级学科博士点和电子信息(控制工程)、能源动力(电气工程)专业学位类别博士授权点,“控制理论与控制工程”“电力电子与电力传动”“检测技术与自动化装置”“模式识别与智能系统”“系统工程”“生物医学工程”“仪器科学与技术”“物流工程“和“交通运输工程”硕士学位授权点,并设有“控制工程”“仪器仪表工程”“生物医学工程”和“物流工程”工程硕士学位授权点和“控制理论与控制工程” 、“生物医学工程”教育硕士学位授权点。
控制科学与工程学院具有完备的人才培养体系,设有“自动化”、“医工融合系”本科教学系,自动化、生物医学工程、智能医学工程、机器人工程本科专业。其中,自动化专业、生物医学工程是国家一流专业,智能医学工程、机器人工程为新工科专业。