上海理工大学理学院现有数学系、物理系、化学系，数学学科、物理学科、化学学科；二级学科博士点：光电子物理与器件、生物医学化学与传感、复杂系统数学理论与方法；一级学科硕士点：数学、物理学、化学；二级学科硕士点：应用数学、基础数学、运筹学与控制论、概率论与数理统计、凝聚态物理、光学、理论物理、绿色化学过程与资源综合利用，以及化学工程专业学位授权点；本科专业：数学与应用数学、应用物理学、应用化学。
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