华南农业大学研究生教育可以追溯到1937年，是全国最早招收农科研究生的学校。1981年我国实施学位制度后，华南农大研究生成为经1981年批准的第一批硕士学位授予单位、1984年批准的第二批博士学位授予单位。 

　　华南农业大学研究生共有9个博士学位授权一级学科，13个硕士学位授权一级学科，49个博士学科专业（含11个自主设置专业、1个专业学位），76个硕士学科专业（含11个自主设置专业、4个专业学位），分属农学、理学、工学、管理学、经济学、法学六个门类，在岗博士生导师179人，硕士生导师605人。设有9个博士后科研流动站。 

　　华南农业大学现有5个国家二级学科重点学科，1个国家二级学科重点（培育）学科，5个农业部重点学科, 3个广东省一级学科重点学科（覆盖12个二级学科，含自主设置二级学科）、7个广东省二级学科重点学科（不含一级学科重点学科下的二级学科）和1个国家林业局重点学科。 

　　截止到2009年10月，华南农业大学在校研究生4889人，其中全日制研究生3742人（包括博士研究生774人，硕士研究生2921人，留学生47人），专业学位在职研究生1147人（包括专业硕士1131人，专业博士16人）。