北京农学院临床兽医学专业于2002年批准为北京市重点建设学科，2003年由学位办批准为硕士研究生授权点。在中兽医药、胚胎工程和宠物临床三个研究方向上形成了鲜明的特色。本学科与日本麻布大学建立姊妹校关系，2007年首次选派2名研究生赴日深造。

　　北京农学院临床兽医学专业现有硕士研究生导师11名，有北京市重点实验室——兽医学（中医药）实验室等2个专业实验室和1个国际培训中心。近5年共承担38项国家及省部级项目，获北京市级奖1项，转让成果17项，发表论文260多篇。北京在职研究生

　　中兽医药方向着重结合近代兽医学理论、实验方法和诊疗手段，揭示中药的效应机理和针灸的作用机制，与此同时，专注于畜禽规模化养殖中系列中兽药的研制开发；胚胎工程方向侧重于胚胎移植、体外受精、胚胎分割、胚胎冷冻保存、胚胎性别鉴定、活体采卵等方面的研究，成果曾获得北京市科技进步奖3项。宠物临床方向针对都市农业特点，开展观赏和伴侣动物疾病的相关研究，采用中西医结合的方法重点解决动物老年性疾病及眼科疾病。