中国科学技术大学软件学院二级学科硕士学位授权点105个，有工商管理(MBA)、公共管理(MPA)和软件工程在职研究生工程硕士3个专业硕士学位授权点；17个博士后流动站，45个博士后流动站专业，具备培养学士、硕士、博士的完整教育体系。中国科学技术大学软件学院软件技术系专业简介如下：

　　计算机应用领域的迅猛扩展和所处理问题的复杂度不断提升，为计算机系统软件和应用软件的研究、开发和应用提供了广阔的发展空间。软件技术系面向软件工程和软件设计技术中的共性问题，所培养的学生出口很广，涉及到IT产业各个领域和层次。软件技术系培养目标是软件企业的中高级软件技术人才，其基本能力应当达到(具有国际水准的)高级程序员、系统设计师和系统分析师水平。在职研究生毕业后具备参与大型系统软件和应用软件项目开发、维护和管理的能力。

　　软件系统设计专业——加强编译技术、操作系统、数据库和计算机网络等理论课程的学习，加强面向对象技术等现代软件系统分析和设计方法的训练，使学生透彻理解软件需求、体系结构和开发过程控制，培养具备独立承担软件开发项目和参与大型软件系统开发组织能力的高级技术人才。

　　电信软件工程专业——培养掌握计算机应用和现代通信技术的基本理论和方法，具有现代软件工程技术意识，对现代电信业务和电信运营支撑与管理系统有很好的理解，具备独立承担或参与组织电信软件工程项目开发能力的高级技术人才。

　　信息安全工程专业——注重信息安全理论和应用技术的结合，强调培养构建信息防护体系和实施信息安全战略管理的思维与策略设计能力，使学生能够胜任网络与系统安全分析、设计和管理等工作。