喀什大学在职研究生培养有师范类专业23个,非师范类专业29个,涵盖教育学、文学、历史学、理学、法学、工学、管理学、经济学、艺术学九个学科门类。喀什大学非全日制研究生教育有教育硕士、工程硕士(生物工程领域)2个专业硕士点。