齐齐哈尔大学在职研究生教育获得工程硕士专业学位非全日制研究生授予权。现有硕士招生一级学科14个，工程硕士非全日制研究生招生在职研究生领域7个：材料工程、电子与通信工程、控制工程、计算机技术、化学工程、纺织工程、工业设计工程。学校设有10个学科门类，其中英语、生物科学、艺术设计、化学工程与工艺等4个专业为教育部特色专业建设点；高分子材料与工程、英语、生物科学、化学工程与工艺、轻化工程、工商管理、应用化学、生物工程、汉语言文学、艺术设计等10个专业为省级重点专业；11个一级学科、72个二级学科具有硕士学位授予权，其中应用化学、遗传学和分析化学3个学科为省级重点学科；形成了以理工科为主，兼有管理学、文学、历史学、法学等门类的在职研究生培养格局。 

　　齐齐哈尔大学在职研究生学院有化学与化学工程学院、计算机与控制工程学院、理学院、文学与历史文化学院、生命科学与农林学院、美术与艺术设计学院、体育学院、外国语学院、经济与管理学院、轻工与纺织学院、机电工程学院、通信与电子工程学院、教育与传媒学院、材料科学与工程学院、食品与生物工程学院、哲学与法学学院、音乐与舞蹈学院、应用技术学院、建筑与土木工程学院、马克思主义学院、国际交流学院、继续教育学院等22个学院。 

　　齐齐哈尔大学非全日制研究生教育已通过新增博士学位授予单位立项。现有应用化学、分析化学、遗传学等3个省级重点学科。亚麻加工技术工程研发中心被批准为教育部工程研究中心，农产品（玉米）深加工工程技术研发中心、大豆精深加工研发中心、亚麻加工技术工程研发中心、通用聚合物复合改性工程技术研发中心等4个中心为省高校工程技术研发中心；精细化工实验室和农产品加工实验室为省高校重点实验室；精细化工培训中心和粮油食品加工技术培训中心为省级振兴东北老工业基地人才培训中心；并在北京设有研发中心。3个省级研究生培养创新示范基地，合作培养企业急需的应用创新型人才。