中山大学深圳校区是以医科和工科为主要学科，拥有文、理、医、工相对齐全的学科体系，以及从本科到博士完整的人才培养体系，具有综合性学科优势的大学校区。校区参照国际上高水平公立大学多校区办学模式，有利于体现社会主义办学优越性，深入贯彻落实“一国两制”，培养爱国爱港青年。着力探索港澳台学生招生培养体质、师资队伍建设机制等改革，有利于为国家高等教育改革探索新路。借助深圳的创新、市场和法治环境，建设以新型工科为重点的国际一流综合性大学校区，有利于加快实施创新驱动发展战略，促进粤港合作，促进建设更加繁荣的粤港澳大湾区，为实现“中国梦”做出更大贡献。  

　　深圳市在医学教育、医疗技术、疾病防控和新药研发等方面的需求巨大，深圳校区将重点建设临床医学、基础医学、公共卫生（卫生政策、流行病学）、药学院（化合药/生物药）以及2家附属医院，与广州校区现有的学科方向实行错位发展。

　　生物医学工程、材料科学和工程、电子通讯是深圳重点发展的新兴产业，深圳市有很强的创新和产业基础和需求，有华大基因、华为等大型企业研发中心，未来中大深圳校区的一流人才培养和科研创新，将与区域和企业的创新需求形成良性互动。

　  航空航天产业是深圳市重点布局和发展的未来产业，深圳校区将重点发展航空电子、无人机、卫星导航应用、精密制造、微小卫星等。