新疆医科大学学位与研究生教育已形成一套较为完善的非全日制研究生教育培养体系。拥有2个一级学科博士学位授权点，25个二级学科博士学位授权点，9个一级学科硕士学位授权点，63个二级学科硕士学位授权点，是全疆唯一的专业学位MD博士研究生培养、公共卫生管理硕士MPH培养及是临床医学、口腔医学、公共卫生学、药学、中药学等非全日制研究生专业学位硕士研究生培养单位。
　　一直把人才培养质量视为学位与研究生教育的生命线，注重非全日制研究生综合素质的全面提高和创新能力的培养，秉承“厚德博学、笃志力行”的校训，发扬“团结奉献、自强不息、精益求精、追求卓越”的新医大精神。坚持“巩固、深化、提高、发展”的教育发展方针和走以内涵发展为主的道路，以培养道德的楷模，学术的精英的高素质，创新型医学专门非全日制研究生人才培养目标为要求，面向未来，面向新疆，服务基层，辐射周边。三十年来，累计培养出各级各类研究生三千余人，其中绝大多数已成为新疆医疗卫生战线的骨干，部分优秀人员已成为全国十大杰出青年，国家杰出青年基金获得者，国家名师，跨世纪人才，百家名医及百千万人才等称号。
　　在对外合作交流方面，新医大一直积极参与国内外知名高校的交流与合作。中南大学、北京中医药大学、吉林大学为我校全面对口支援大学，同时，我们同北京大学、上海交通大学、山东大学、上海中医药大学、浙江大学等20余所大学建立了长期的合作关系。在国外，与美、日、英、法、德、俄、巴基斯坦等多个国家大学及研究机构建立了校际合作关系。特别是近几年来，学校国际教育的规模和质量不断提升，学历被阿联酋、沙特、巴基斯坦等多个国家认可，学历教育人数包括博士、硕士、本科层次近600人，学校在周边国家的影响力不断增强，被教育部授予首批接受政府奖学金的高校、来华留学生教育先进集体。我校被批准成为自治区首批来疆留学高校示范基地。
　　在学校“坚持以人为本，建设和谐校园；实施读书工程，建设书香校园，坚持环境育人，建设绿色校园”的办学理念和育人思想指引下，研究生学院加大改革力度，勇于开拓创新，在非全日制研究生招生、培养、管理和学位授予方面采取了一系列措施，取得了比较明显的成效。今后，研究生学院将在进一步提高培养教育质量的基础上，努力加强学科建设，优化结构，深化教育改革，提升学校的办学层次，为实现把学校建设成为高水平的教学研究型医科大学的目标而努力奋斗。